秭歸臍橙之所以含有豐富的營養物質，其主要原因就是因為當地獨特的地理環境。秭歸地處三峽河谷地區，受秦巴山脈及三峽水庫影響，河谷地帶氣候特殊，為湖北冬暖之最。境內氣候溫和，冬暖夏涼，雨量充沛，屬亞熱帶季風氣候。平均氣溫17.5—20℃，月均溫≥10℃的年活動積溫為5723.6℃，年日照時數1631.52小時，空氣相對濕度72%，年無霜期在306天以上，年平均降雨量1016毫米。境內山巒重疊，群峰交錯，氣候類型多樣，逆溫層效應、坡壁效應、水體效應顯著，立體氣候和冬暖特征獨特，極少遇到冬害。三峽庫區蓄水至175米后，在強大庫區水體的作用下，年均氣溫將提高1℃左右，冬季平均增溫0.3℃—1.3℃，年極端最低溫度提高2℃左右，夏季平均降溫0.9—1.2℃，是湖北著名的冬暖區的秭歸臍橙栽培的最佳適宜區。